为了向联邦学生会发出呼吁，RABBIT小队决定参加晄轮大祭。 在制定比赛计划的时候，她们察觉到在主办学校千年科学学院中有不安定因素在暗中涌动的迹象。 兔子小队想要通过自身的力量来解决危险，企划着千年潜入作战计划。 另一方面，负责监控晄轮大祭筹备的千寻察觉到了有人入侵了千年，为了迎击而启动了安全防御系统。